Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pou5f1P20263 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms