Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VimP20152 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VimP20152 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VimP20152 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VimP20152 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VimP20152 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VimP20152 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms