Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PdgfaP20033 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PdgfaP20033 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms