Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NelfeP19426 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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