Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lama1P19137 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lama1P19137 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lama1P19137 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lama1P19137 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms