Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18525 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P18525 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
P18525 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P18525 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P18525 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P18525 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P18525 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms