Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtsdP18242 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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