Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcnaP17918 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcnaP17918 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms