Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs2P17534 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms