Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnc1P15388 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms