Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FosbP13346 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
FosbP13346 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FosbP13346 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FosbP13346 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FosbP13346 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FosbP13346 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FosbP13346 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FosbP13346 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FosbP13346 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms