Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scg5P12961 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scg5P12961 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms