Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a1P12813 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nr4a1P12813 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms