Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctla2bP12400 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms