Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OtcP11725 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OtcP11725 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OtcP11725 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
OtcP11725 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OtcP11725 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms