Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Defa1P11477 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa1P11477 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms