Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spp1P10923 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spp1P10923 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms