Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
P10404 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
P10404 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P10404 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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P10404 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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P10404 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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P10404 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P10404 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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P10404 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P10404 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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