Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxb4P10284 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxb4P10284 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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