Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp28P10078 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp28P10078 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms