Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnmt3cP0DOY1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dnmt3cP0DOY1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms