Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Jmjd7P0C872 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Jmjd7P0C872 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms