Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbk3P0C5K0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms