Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf1P09925 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf1P09925 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf1P09925 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms