Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hoxa9P09631 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa9P09631 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms