Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxb5P09079 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxb5P09079 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Hoxb5P09079 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxb5P09079 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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