Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P06344 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P06344 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P06344 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06344 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06344 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06344 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06344 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06344 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P06344 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P06344 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms