Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tk1P04184 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tk1P04184 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms