Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HbaP01942 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HbaP01942 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HbaP01942 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HbaP01942 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HbaP01942 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HbaP01942 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HbaP01942 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms