Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01734 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01734 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01734 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01734 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01734 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01734 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01734 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01734 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms