Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01641 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01641 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01641 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01641 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01641 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01641 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01641 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms