Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ccl20O89093 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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