Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AfmO89020 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AfmO89020 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AfmO89020 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
AfmO89020 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AfmO89020 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AfmO89020 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
AfmO89020 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AfmO89020 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AfmO89020 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AfmO89020 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AfmO89020 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AfmO89020 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms