Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd160O88875 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd160O88875 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms