Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CcnkO88874 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CcnkO88874 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CcnkO88874 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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