Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClppO88696 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClppO88696 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClppO88696 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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ClppO88696 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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ClppO88696 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClppO88696 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ClppO88696 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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