Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops3O88543 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cops3O88543 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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