Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CntfrO88507 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CntfrO88507 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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