Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Capns1O88456 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Capns1O88456 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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