Protein–RNA interactions for Protein: O88413

Tulp3, Tubby-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp3O88413 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp3O88413 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp3O88413 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms