Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a1O88207 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a1O88207 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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