Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx7O70439 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx7O70439 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stx7O70439 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms