Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vamp8O70404 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vamp8O70404 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms