Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtssO70370 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtssO70370 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtssO70370 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtssO70370 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtssO70370 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms