Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RngttO55236 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RngttO55236 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RngttO55236 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RngttO55236 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RngttO55236 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RngttO55236 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RngttO55236 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms