Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Aff2O55112 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aff2O55112 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aff2O55112 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aff2O55112 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Aff2O55112 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Aff2O55112 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aff2O55112 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aff2O55112 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aff2O55112 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Aff2O55112 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aff2O55112 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aff2O55112 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aff2O55112 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms