Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr1O55100 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms