Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnf13O54965 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf13O54965 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf13O54965 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rnf13O54965 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rnf13O54965 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf13O54965 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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