Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DffaO54786 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DffaO54786 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DffaO54786 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DffaO54786 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DffaO54786 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DffaO54786 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DffaO54786 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms