Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gp1baO35930 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms